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| 名前 | 有効なボス | 効果 |
| ニューロックバスター （R．BUSTER） 
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− | ロックマンが最初から使える武器。 貫通性はないものの、１度に３連射までできます。 また、武器ボタンを押し続けるとチャージショットで攻撃できます。 チャージショットはロックバスターの３倍の威力で、 ロックバスターをあと1発当てると倒せる敵を貫通します。 武器エネルギーを使わないので、無限に使用可能。 |
| フラッシュストッパー （BRIGHT）  |
ファラオマン | 敵の動きを一定時間止め、バスターで攻撃できます。 ただし、動きを止めている間は他の武器に変えることができません。 敵が沢山出るところや、中ボス戦でお世話になることでしょう。 ブライトマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| レインフラッシュ （TOAD）  |
ブライトマン | 発射から発動までが長く燃費も悪いですが、画面全体に攻撃できる上に、 ロックバスターが効かない状態の敵にもそのままダメージを与えられます。 本家と違って腰振りなしで発動可能です（笑） トードマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| ドリルボム （DRILL）  |
トードマン ワイリーマシン4号 （第二形態） |
地形や敵にヒットすると爆発するドリル型の爆弾を発射します。 ヒットする前にもう１度武器ボタンを押せば、 押した瞬間に爆発させる事ができます。 また、ステージ中の特定の壁を破壊できます。 ドリルマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| ファラオショット （PHARAOH）  |
リングマン コックローチツイン ワイリーカプセル |
＋キーを入れながら撃つことで３方向に撃ち分けができて、 武器ボタンを押しつづけることでため撃ちができます。 ためると頭の上にエネルギーが収束していきますが、 これを直接当てても敵にダメージを与える事ができて、 ロックマンの死角である上方向を補えるので便利です。 また、頭の上の弾は直接当たると消えますが、 武器エネルギーは消費せずにため状態はそのまま維持されます。 ファラオマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| リングブーメラン （RING）  |
ダストマン モスラーヤ メットールダディ タコトラッシュ ワイリーマシン4号 （第一形態） |
発射してから一定の距離まで進むと ロックマンのいる場所まで戻ってくるリングを発射します。 貫通性があり、効かない敵に当たっても戻って来るまでは消えません。 これが有効なボスは多いので、使用頻度は高いです。 リングマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| ダストクラッシャー （DUST）  |
ダイブマン スカルマン スクエアーマシン コサックキャッチャー メットールダディ |
敵に当たると4方向に分裂するゴミを凝縮した弾を発射します。 もちろん、分裂した破片でもダメージを与えられます。 ダストマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| ダイブミサイル （DIVE）  |
ドリルマン | 発射すると近くの敵に自動的に向かっていきます。 他の武器で届きづらい敵や狙いを付けづらい敵に有効です。 ダイブマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| スカルバリアー （SKULL）  |
ダイブマン | 敵の弾を防ぐドクロ型のバリアーがロックマンの周囲を回ります。 特定の敵にはバリアを直接当てる事でダメージを与えられる上に 大抵の弾は防げますが、敵に当たるか１度敵の弾を防ぐと消えます。 スカルマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| ラッシュコイル （R.COIL）  |
− | 最初から使えて、ラッシュの上に乗る事で大ジャンプができます。 ジャンプで届かない場所でお世話になるでしょう。 呼びだしている間はロックバスターで攻撃できます（ため不可）。 壁際では呼び出せず、呼び出した状態でロックマンがダメージを受けると、 ロックマンのいる位置までワープしてくる妙な性質があります。 |
| ラッシュマリン （R.MARINE）  |
− | ラッシュが水中仕様に変形し、水中を上下左右に移動できます。 搭乗中はロックバスターで攻撃できます（ため不可）。 陸上では呼べず、水中から陸上に出ることはできません。 トードマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| ラッシュジェット （R.JET）  |
− | 乗ると出した方向に向かって空中を移動し続け、 ＋キー上下で若干の軌道修正ができます。 呼びだしている間はロックバスターで攻撃できます（ため不可）。 ちなみに、水中では呼ぶことができません。 ドリルマンステージをクリアすると使えるようになります。 |
| ワイヤー （WIRE） |
コサックキャッチャー ワイリーマシン4号 （第二形態） |
地上にいる時に＋キーを上に入れながら武器ボタンで 真上にワイヤーを伸ばし、天井に届くとそのまま天井まで移動できます。 また、天井に捕まってる間はロックバスターで攻撃できます（ため不可）。 敵に当てることで攻撃にも使えますが威力は低め。 ダイブマンステージで入手できます。 （詳しい場所についてはステージ攻略の方を参照のこと） |
| バルーン （BALOON） |
− | 垂直に上昇していくバルーンを出します。 ロックマンが乗ると上昇速度が遅くなり、出せるのは画面内に3つまで。 ファラオマンステージで入手できます。 （詳しい場所についてはステージ攻略の方を参照のこと） |