通常版　　 GBA　2002年 12月 6日発売　　4800円
BLACK　　GBA　2003年 3月 28日発売　　4800円
（第17回次世代ワールドホビーフェアの会場内物販、コロコロの誌上通販（2003年2月）にて先行発売）

攻略コンテンツ ※特に記述のない部分では通常版（通称「ホワイト版」）とBLACK版とでデータは共通にする予定ですが、 一部通常版のみの記述のままの物が多々ありますので注意。

よくある質問 ・・・ ストーリーやクリア後で質問が多そうな、多かったところのまとめ。 ストーリー攻略 ・・・ ストーリーのチャート式攻略他。(クリア後はとりあえずFAQ形式で) 第1話 / 第2話 / 第3話 / 第4話 / 第5話 / 第6話 / 第7話 / 第8話 クリア後 / タイムアタック / 隠しモード エリアデータ ・・・ インターネット・電脳世界で入手できるアイテム、プラグインできる場所などのデータ。 インターネット 現実・小規模電脳世界 電脳世界（ダンジョン） : 校長ノートPCの電脳 / 動物園の電脳 / 病院の電脳 / WWWの電脳 スタイルチェンジ ・・・ スタイルチェンジについて。　 ショップデータ ・・・ ネット・サブチップ・プログラム商人・バグのかけら交換所の場所・商品リスト。　 チップデータ ・・・ チップの性能のまとめ、入手法。 スタンダード ： 1〜50 / 51〜100 / 101〜150 / 151〜200 メガクラス ： ナビチップ / その他 ギガクラス BLACK版限定のチップ ネットナビ　・・・ ネットナビの簡単な攻略、出現場所のまとめ。 攻略 / 攻略（クリア後） / 出現場所 ウイルス　・・・ ウイルスの出現場所、落とすチップ、コード別の入手条件。　 飼育ウイルス　・・・ 飼育ウイルスのリスト、SPウイルス、ウイルスチップの効果。 飼育ウイルスリスト / SPウイルス / チップ効果 / プログラムアドバンス ・・・ プログラムアドバンスのリスト、使用チップのコード別入手法(を載せる予定)。　 ナビカスタマイザー ・・・ 各種パーツのリスト・入手法、各種コード、圧縮、ナビカスのバグ効果。 プログラムパーツ / BLACK版でのみ入手できるプログラムパーツ / プラスパーツ / スピンパーツ / 改造・エキストラコード / 圧縮コマンド / バグ効果 強化プログラム ・・・ HPメモリ、サブメモリ、かくちょうメモリ、レギュラーUPの入手法。 HPメモリ・サブメモリ・かくちょうメモリ / レギュラーUP 依頼攻略 ・・・ 依頼掲示板で受けられる依頼の攻略。　 サブイベント ・・・ クリアには関係ないけどやっておくと少しお得なイベント。　 小イベント / チップ交換 / クイズ対決 / ギャンブル ロットナンバー ・・・ エグゼ3で使えるロットナンバーのリスト。　 攻略知識集 ・・・ エグゼ3の基礎知識、役立ちそうな事や、チップコマンド等の豆知識など。　 バトル中のパネル・障害物 / チップのコマンド技 / 小ネタ・裏技

攻略への情報提供、攻略中のミスや誤字などありましたら、メールで教えてもらえるとありがたいです。 攻略への情報提供者様 AMOさん、鉄人３８号さん、yx10c20さん、サンタさん、藤花さん、どぼこりさん、kyoさん、非我さん、 darkさん、かあびいさん、kojiさん、ユウさん、てっちゃんさん、seburanさん、パピーさん、ＴＯＭＯさん、 こばくんさん、ロックマンさん、ひろぽんさん、プロトバグSPさん、shunさん、ＺＥＲＯさん、うえさん、 シルバさん、プロトさん、光ノットさん、ごべーるびっとさん、Σさん、ゴスペルＳＰさん、フォルテGSさん、 ｋさん、ドリームメラルさん、takaさん、keiさん、神威さん、エレキブラザーのJさん、だーくさん、 クロちゃんさん、DDTさん、Mr.マスターさん、シャークさん、熊坂哲也さん （同じ内容の情報を送って下さった方々については最も早かった方のお名前を載せています）